MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011988	GGC	2	6	182208	182213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106281
3502	NC_011988	GATC	2	8	182216	182223	25 %	25 %	25 %	25 %	222106281
3503	NC_011988	GCC	2	6	182262	182267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106281
3504	NC_011988	GCT	2	6	182268	182273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3505	NC_011988	CGG	2	6	182462	182467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106281
3506	NC_011988	GAA	2	6	182615	182620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106281
3507	NC_011988	TTTC	2	8	182803	182810	0 %	75 %	0 %	25 %	222106281
3508	NC_011988	ATG	2	6	182827	182832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106281
3509	NC_011988	TCG	2	6	182866	182871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3510	NC_011988	AAT	2	6	182910	182915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106281
3511	NC_011988	TGC	2	6	182987	182992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3512	NC_011988	ATCCTG	2	12	183184	183195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222106281
3513	NC_011988	GCA	2	6	183380	183385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3514	NC_011988	AGA	2	6	183434	183439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106281
3515	NC_011988	GCA	2	6	183443	183448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3516	NC_011988	CAG	2	6	183506	183511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3517	NC_011988	TGC	2	6	183517	183522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3518	NC_011988	GGCAAT	2	12	183690	183701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222106281
3519	NC_011988	CGG	2	6	183725	183730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106281
3520	NC_011988	CCG	2	6	183760	183765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106281
3521	NC_011988	GGC	2	6	183786	183791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106281
3522	NC_011988	ATC	2	6	183850	183855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106281
3523	NC_011988	ACG	2	6	183985	183990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3524	NC_011988	AG	3	6	184087	184092	50 %	0 %	50 %	0 %	222106281
3525	NC_011988	GTG	2	6	184108	184113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106281
3526	NC_011988	GACAC	2	10	184149	184158	40 %	0 %	20 %	40 %	222106281
3527	NC_011988	GAC	2	6	184160	184165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106281
3528	NC_011988	GC	3	6	184175	184180	0 %	0 %	50 %	50 %	222106281
3529	NC_011988	GGC	2	6	184200	184205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106281
3530	NC_011988	TTGG	2	8	184231	184238	0 %	50 %	50 %	0 %	222106281
3531	NC_011988	TGA	2	6	184461	184466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106281
3532	NC_011988	TTG	2	6	184479	184484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106282
3533	NC_011988	TGG	2	6	184491	184496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106282
3534	NC_011988	GCA	2	6	184648	184653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106282
3535	NC_011988	GCA	2	6	184660	184665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106282
3536	NC_011988	GCC	2	6	184691	184696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106282
3537	NC_011988	TGG	2	6	184906	184911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106282
3538	NC_011988	CTGTC	2	10	184974	184983	0 %	40 %	20 %	40 %	222106282
3539	NC_011988	TGAC	2	8	185226	185233	25 %	25 %	25 %	25 %	222106283
3540	NC_011988	ATT	2	6	185240	185245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106283
3541	NC_011988	TGA	2	6	185251	185256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106283
3542	NC_011988	CGC	2	6	185341	185346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106283
3543	NC_011988	T	6	6	185402	185407	0 %	100 %	0 %	0 %	222106283
3544	NC_011988	ACA	2	6	185415	185420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106283
3545	NC_011988	GC	4	8	185434	185441	0 %	0 %	50 %	50 %	222106283
3546	NC_011988	GAA	2	6	185447	185452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106283
3547	NC_011988	TCA	2	6	185538	185543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106283
3548	NC_011988	AGC	2	6	185548	185553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106283
3549	NC_011988	GCGG	2	8	185581	185588	0 %	0 %	75 %	25 %	222106283
3550	NC_011988	CGT	2	6	185602	185607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106283
3551	NC_011988	CGA	2	6	185625	185630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106283
3552	NC_011988	TGGCG	2	10	185788	185797	0 %	20 %	60 %	20 %	222106283
3553	NC_011988	CGGAG	2	10	185862	185871	20 %	0 %	60 %	20 %	222106283
3554	NC_011988	CGG	2	6	185908	185913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106284
3555	NC_011988	TCA	2	6	185989	185994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106284
3556	NC_011988	CCG	2	6	186063	186068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106284
3557	NC_011988	CAG	2	6	186086	186091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3558	NC_011988	GCA	2	6	186103	186108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3559	NC_011988	GCA	2	6	186154	186159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3560	NC_011988	AGC	2	6	186174	186179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3561	NC_011988	CAG	2	6	186200	186205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3562	NC_011988	ACCG	2	8	186324	186331	25 %	0 %	25 %	50 %	222106284
3563	NC_011988	CTC	2	6	186437	186442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106284
3564	NC_011988	GCC	2	6	186509	186514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106284
3565	NC_011988	GCG	2	6	186518	186523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106284
3566	NC_011988	CAG	2	6	186596	186601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3567	NC_011988	CAA	2	6	186616	186621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106284
3568	NC_011988	CGAT	3	12	186803	186814	25 %	25 %	25 %	25 %	222106284
3569	NC_011988	TTC	2	6	186833	186838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106284
3570	NC_011988	CGG	2	6	186958	186963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106284
3571	NC_011988	GCA	2	6	186982	186987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3572	NC_011988	CAT	2	6	187022	187027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106284
3573	NC_011988	CTG	2	6	187055	187060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3574	NC_011988	GAC	2	6	187169	187174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3575	NC_011988	CCG	2	6	187203	187208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106284
3576	NC_011988	CGT	2	6	187223	187228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3577	NC_011988	AGC	2	6	187242	187247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3578	NC_011988	CGC	2	6	187260	187265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106284
3579	NC_011988	AGC	2	6	187302	187307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106284
3580	NC_011988	AAG	2	6	187308	187313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106284
3581	NC_011988	GGC	2	6	187400	187405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106284
3582	NC_011988	GTC	2	6	187553	187558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_011988	CATG	2	8	187569	187576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_011988	CTG	2	6	187629	187634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_011988	TGC	2	6	187736	187741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_011988	G	6	6	187815	187820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_011988	GGGA	2	8	187830	187837	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011988	GGC	2	6	187864	187869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_011988	TCA	2	6	187972	187977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106285
3590	NC_011988	AGATC	2	10	188077	188086	40 %	20 %	20 %	20 %	222106285
3591	NC_011988	CG	3	6	188089	188094	0 %	0 %	50 %	50 %	222106285
3592	NC_011988	CGC	2	6	188113	188118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106285
3593	NC_011988	TGCG	2	8	188172	188179	0 %	25 %	50 %	25 %	222106285
3594	NC_011988	GAA	2	6	188198	188203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106285
3595	NC_011988	GGCC	2	8	188254	188261	0 %	0 %	50 %	50 %	222106285
3596	NC_011988	ACC	2	6	188276	188281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106285
3597	NC_011988	CTT	2	6	188341	188346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106285
3598	NC_011988	AGG	2	6	188416	188421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106285
3599	NC_011988	AACGG	2	10	188466	188475	40 %	0 %	40 %	20 %	222106285
3600	NC_011988	TGC	2	6	188498	188503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106285
3601	NC_011988	GATCA	2	10	188534	188543	40 %	20 %	20 %	20 %	222106285
3602	NC_011988	CTG	2	6	188588	188593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106285
3603	NC_011988	GGT	2	6	188635	188640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106285
3604	NC_011988	CCG	2	6	188691	188696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106285
3605	NC_011988	TCG	2	6	188808	188813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106285
3606	NC_011988	GAT	2	6	188821	188826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106285
3607	NC_011988	AGG	2	6	188831	188836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106285
3608	NC_011988	CAGAT	2	10	188850	188859	40 %	20 %	20 %	20 %	222106285
3609	NC_011988	GCG	2	6	188975	188980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106285
3610	NC_011988	CGT	2	6	189023	189028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106285
3611	NC_011988	CTT	2	6	189047	189052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106285
3612	NC_011988	GAA	3	9	189161	189169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106285
3613	NC_011988	GCC	2	6	189212	189217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106285
3614	NC_011988	GCC	2	6	189287	189292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106285
3615	NC_011988	CCG	2	6	189354	189359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106285
3616	NC_011988	TCG	2	6	189381	189386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106285
3617	NC_011988	CGC	2	6	189425	189430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106285
3618	NC_011988	TTC	2	6	189575	189580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106285
3619	NC_011988	TTG	2	6	189687	189692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106285
3620	NC_011988	GCG	2	6	189766	189771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106285
3621	NC_011988	GCT	2	6	189778	189783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106285
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3990	NC_011988	AAG	2	6	210080	210085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106300
3991	NC_011988	GGT	2	6	210141	210146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106300
3992	NC_011988	AGC	2	6	210207	210212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106300
3993	NC_011988	TTC	2	6	210215	210220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106300
3994	NC_011988	CTG	2	6	210242	210247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106300
3995	NC_011988	GACA	2	8	210286	210293	50 %	0 %	25 %	25 %	222106300
3996	NC_011988	GC	3	6	210299	210304	0 %	0 %	50 %	50 %	222106300
3997	NC_011988	ACCG	2	8	210326	210333	25 %	0 %	25 %	50 %	222106300
3998	NC_011988	TCA	2	6	210348	210353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106300
3999	NC_011988	GTC	2	6	210434	210439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106300
4000	NC_011988	CCG	2	6	210469	210474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106300

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